Undiksha didirikan pada tahun 2006. Namun, sejarah perjalanan kampus ini sudah dimulai sejak tahun 1950-an dengan misi utama untuk memenuhi kebutuhan guru di Indonesia. Dulunya, Undiksha merupakan bagian dari Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan Universitas Airlangga Surabaya.