Politeknik Pertanian Negeri Pangkajene Kepulauan (Polipangkep) didirikan pada tahun 1989 sebagai bagian dari upaya untuk meningkatkan mutu pendidikan vokasi di bidang pertanian dan perikanan. Awalnya dikenal sebagai Politeknik Pertanian Universitas Hasanuddin, Polipangkep kemudian menjadi institusi mandiri pada tahun 1994.